Το Συμβούλιο Αξιολόγησης και Πιστοποίησης (ΣΑΠ) της Εθνικής Αρχής Ανώτατης Εκπαίδευσης (ΕΘΑΑΕ) πιστοποίησε ότι το νέο ΠΜΣ του Τμήματος Ιστορίας συμμορφώνεται πλήρως με τις αρχές του Προτύπου Ποιότητας για την πιστοποίηση των Νέων Προγραμμάτων Μεταπτυχιακών Σπουδών σε λειτουργία της ΕΘΑΑΕ και τις Αρχές και Κατευθυντήριες Οδηγίες για την Διασφάλιση Ποιότητας στον Ευρωπαϊκό Χώρο Ανώτατης Εκπαίδευσης (ΕSG) για το επίπεδο σπουδών 7 του Εθνικού και Ευρωπαϊκού Πλαισίου Προσόντων.
Το σχετικό Μνημόνιο Συνεργασίας υπογράφηκε από το Ιόνιο Πανεπιστήμιο και τη Στρατιωτική Σχολή Ευελπίδων τον Δεκέμβριο του 2022 με μια συμφωνία που προέβλεπε, μεταξύ άλλων, τον σχεδιασμό ενός νέου, καινοτόμου κοινού Προγράμματος Μεταπτυχιακών Σπουδών με αντικείμενο την στρατιωτική ιστορία.